По одной из версий название камня произошло от французского «citron», что означает «лимонно-желтый». Но цвет цитрина может быть не только лимонным — это множество оттенков желтого, включая тот же лимонный, медовый, янтарный. Наверное, отсюда и появилась вторая теория. Согласно ей «citrus» — желтый в переводе с латыни.
Из-за своих магических свойств цитрин стал популярен среди адептов эзотерических учений. Его используют во время магических ритуалов, для медитаций, а также для сеансов камнетерапии.